阿龍納克斯教授是研究海洋生態的專家，1866年出現海怪以後，海洋非常不平靜，發生許多船隻遭不明物體攻擊的離奇事件，阿龍納克斯就被美國政府找來協助調查。但是，他的發現竟是出乎意料之外，因為攻擊船隻的「怪物」並不是任何一種海中生物，而是一艘由瘋船長內默所駕駛的水底船。
內默船長偏執厭世，討厭世界的人類。他操縱著自己所發明的潛艇「諾第路斯號」報復世人，他假裝為海怪攻擊海上船隻，徜徉在他所醉心建構的海底王國。要查明失事原因的亞伯拉罕‧林肯號，也不幸發生海難。
教授跟他的助手康塞爾、擲魚標手蘭德，三個人幸運活下來。最後發現了內默船長的潛艇、了解到這位船長的生存哲學，教授嘗試要改變內默船長的觀念，但終究是功敗垂成。他們一起到意想不到的深海中探險，和鯊魚纏鬥、尋找寶物，和大章魚搏鬥，內默船長與他的潛艇最後還是沉沒在深邃的汪洋之下……。 |
